基础条件：
1、实验室应选择清洁安静的场所，远离生活区，锅炉与交通要道；
2、实验室应选择在光线充足、通风良好的场所，要与生产加工车间有一定的距离；
3、实验室应选择在方便取样和检验，距离车间较近的工作场所。
根据生产实际需要，一般工厂应该设置细菌与理化检验兼有的结合实验室，主要包括以下三大部分；细菌实验室、理化实验室、办公室。
A. 办公室
B.理化实验室（或者和细菌操作室合并）理化分析室（兼作感官检验室） 仪器室（兼放细菌室显微镜等少量仪器）
C.细菌实验室：细菌检验操作室；无菌室 ；培养基制作室；④洗涤消毒室
实验室设备及装备配置要求：
食品检验检测实验室可根据生产的产品品种、检测项目的多少和生产规模的大小设置，实验室设备及装备的配置也可繁可简。
食品检验可分两项：一是检测产品的品质项目；二是检测产品的卫生项目，这一类项目的检测难度相对大、投资高。
食品检验检测实验室品质项目筹建：
品质项目包括水分、含盐量、含糖量、蛋白质含量、脂肪含量、纤维含量、维生素含量、酸度等。对于这些项目的检测，如果经费有限，都可以采用化学分析，只需配置最简单的烘箱、水浴、电炉、搅拌机、粉碎机、PH计等设备即可。如：紫外/可见分光光度计、近红外分析仪、自动滴定仪等。检测维生素A、E等有时还需要配置荧光光度计。检测营养元素，如钙锌、铁等，可购置原子吸收-火焰检测仪器。
食品检测实验室卫生项目筹建：
卫生项目包括微生物、添加剂、有害元素、农药残留、兽药残留、毒素等。对于一般食品企业，微生物检测实验室应该参照以下检测项目配置：
1、微生物：建微生物实验室要按照生物实验室设备及装备规范标准要求进行布局。必要的设备有洁净台、培养箱、高压灭菌锅、电炉等，其它设备则根据具体检测项目配置。经费少的可以购买国产的，经费多的可以购买进口的，两者价格相差很多。
2、添加剂和有害元素：有一部分项目可以用化学法，如亚硝酸盐、二氧化硫、重金属含量、总砷等。但要想满足现在的国际食品卫生要求，应该购置气象色谱-氢火焰检测器、液相色谱-紫外/可见光检测器，这样一般的防腐剂（苯甲酸、山梨酸）、甜味剂（甜蜜素、糖精钠等）、色素（柠檬黄、胭脂红等）都可以检测了。购置原子吸收仪-石墨炉检测器，可分别检测铅、铬、镉、铜、镍等有害元素，还需要一台原子荧光仪，用来检测砷和汞等。
3、残留农药：检测残留农药气象色谱是不能少的。检测有机氯农药，需配置电子俘获ECD检测器；检测有机磷农药，需配火焰光度FPD检测器或氮磷NPD检测器。现在做残留检测的项目越来越多，为提高通用性，建议配置毛细管柱分流/不分流进样口，安装毛细管色谱柱。与传统填充色谱柱相比，毛细管色谱柱分析项目多，分离度好，可以减少频繁的更换色谱柱，提高分析效率。出口食品加工企业生产的产品在出口时需要检测的农残项目越来越多，为了把好生产原料和产品质量关，可以配置气相色谱-质谱仪。一般只需配置电子轰击EI源，如果有必要，可再配置一个负化学NCI源。是选择四级质谱仪还是离子阱质谱仪，两种仪器各有优缺点，要看具体情况。
4、残留兽药：若进行残留兽药的检测，项目不多且批次多，可以考虑配置酶联免疫仪，该仪器一次投入不大，操作简便，检测灵活度高。采用ELISA也有一些缺点，一是试剂盒为长期的消耗品，成本甚至比仪器分析还高。对于联质谱仪，第一台仪器建议配置三重四级质谱仪，灵敏度高、重现性好。仪器不一定要追求高配置，够用就行，但灵敏度、稳定度、抗污染等性能要好。最好买用户较多的型号，有一个与检测项目相近的用户群，首先说明该型号仪器检测拟验的项目没有问题，其次也便于今后技术交流。
